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‘天博’NVIDIA和哈佛研究人员使用AI使基因组分析更快,更便宜-手机评测

发布时间:2021-06-25 00:48 来源: 未知 浏览次数:

本文摘要:来自NVIDIA和哈佛大学的科学家在遗传研究中取得了巨大的突破。他们开发了深入的学习套件,大大降低了运行稀有单细胞实验所需的时间和成本。根据自然新闻发表的一项研究,AtacWorks工具包可以推断给整个基因组,通常需要超过两天,而在半小时内。感谢Nvidia Tensor Core GPU,它可以这样做。 ATACWorks与ATAC-SEQ一起使用,ATAC-SEQ是一种公认的方法,可以在健康和生病细胞基因组中找到一个开放区域。

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来自NVIDIA和哈佛大学的科学家在遗传研究中取得了巨大的突破。他们开发了深入的学习套件,大大降低了运行稀有单细胞实验所需的时间和成本。根据自然新闻发表的一项研究,AtacWorks工具包可以推断给整个基因组,通常需要超过两天,而在半小时内。感谢Nvidia Tensor Core GPU,它可以这样做。

ATACWorks与ATAC-SEQ一起使用,ATAC-SEQ是一种公认的方法,可以在健康和生病细胞基因组中找到一个开放区域。这些“开放区域”是人类DNA的一小部分,用于确定和激活特定功能(如肝脏,血液或皮肤细胞)。这是人类基因组的一部分,提供科学家提供一个人可能具有阿尔茨海默病,心脏病或癌症的迹象。

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ATAC-SER通常需要分析数千个细胞,但ATACWORKS只能通过数万个细胞获得相同的结果。研究人员还应用Atacworks生产红细胞和白细胞数据集,通常无法使用常规方法。然而,使用Atacworks,它们可以分别识别与白细胞和红细胞相关的DNA的不同部分。

更快,便宜地分析基因组识别某些疾病的特定突变或生物标志物的能力。它甚至可以通过帮助研究人员澄清疾病的工作原则来帮助发现药物。NVIDIA研究人员和论文的主要作者表示:“对于非常罕见的细胞类型,不可能使用现有方法来研究DNA的差异。“”Atacworks不仅可以帮助降低收集收集的染色质的可访问性数据的成本,而且还开辟了药物发现和诊断的新可能性。

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